Das Haupteinsatzgebiet der DHPLC (Denaturating High Performance Liquid Chromatography) ist die Mutationsanalyse krankheitsverursachender Gene. Mit dieser Technik lassen sich SNPs, kleinere Insertionen und Deletionen in DNA-Fragmenten detektieren, gleichzeitig ist diese Methode wesentlich schneller, kostengünstiger und weniger aufwändig als die Komplettsequenzierung eines Gens.